PATHOTRACKFISH

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Depuis une vingtaine d'années, les apports de la pêche mondiale sont stables et aucune augmentation significative n'est prévue en raison de l'état actuel des stocks de poissons sauvages. L'approvisionnement futur du marché mondial en produits aquatiques repose donc sur l'essor de l'aquaculture. D'après la FAO, pour répondre aux besoins, il faut que la production aquacole double d'ici 2030. Si l'aquaculture mondiale s'est considérablement développée (c'est le secteur agroalimentaire qui connaît la plus forte croissance) elle doit faire face à de nombreux défis.
Les conditions sanitaires sont un frein majeur au développement de l'aquaculture et limitent la productivité des fermes aquacoles.

Les objectifs du projet sont de développer et d'utiliser des outils directement dérivés de la connaissance des génomes bactériens pour mieux comprendre l'émergence des pathogènes du genre Tenacibaculum et entreprendre des démarches prophylactiques rationnelles en pisciculture.
Il s'agira en pratique :
1- de constituer une collection de souches de référence des Tenacibaculum pathogènes des poissons et de caractériser génétiquement ces souches avec une méthode de référence (Multi-Locus Sequence Typing) afin d'élucider la structure des populations de bactéries qui s'attaquent aux élevages,
2- d'étudier le génome de certaines de ces souches par les méthodes les plus avancées de séquençage et de cartographie optique afin d'identifier les déterminants génétiques associés à la virulence et à l'adaptation à leurs hôtes des Tenacibaculum pathogènes ainsi que des cibles pour le développement d'une méthode de typage de terrain,
3- de mettre au point les outils de détection et de suivi épidémiologique des souches utilisables par les acteurs de la filière et de les valider,
4- de conduire l'évaluation rationnelle d'un candidat vaccin.

Ce projet, labellisé par le Pôle de Compétitivité AQUIMER le 22 avril 2010, est co-labellisé par les Pôles Atlanpôle Biothérapies et Q@li-Méditerranée.

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16 rue du Commandant Charcot
62200 Boulogne-sur-Mer F

Tel : +33 3 21 10 78 98

Fax : +33 3 21 30 33 22

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